對FFU風機過濾單元進行適當的維護保養可以提高FFU風機過濾單元的壽命，對企業節省一定的費用。
一、根據環境的潔凈度，FFU風機過濾單元更換過濾器（初效一般為1-6個月，一般為6-12個月,過濾器不可清洗）。
二、定期（一般每兩個月一次）用塵埃粒子計數器測定用本產品實施凈化的潔凈區域的潔凈度，當實測的潔凈度與要求的潔凈度不符時，應查明原因（是否有泄漏、過濾器是否有失效等），若過濾器已失效，則應更換新的過濾器。
三、更換過濾器及初效過濾器時應停機進行。
四、FFU風機過濾單元更換過濾器時應注意以下事項：
1、FFU機過濾單元更換過濾器時應特別注意拆箱、搬運及安裝取用時確保濾紙完整無損，禁止用手觸及濾紙造成破損。
2、FFU安裝前，將新的過濾器對著亮處，以肉眼觀察過濾器是否因運輸等原因而出現破損，如濾紙有漏洞則不能使用。
3、FFU更換過濾器時應首先將箱體抬起，然后將失效的過濾器取出，換上新的過濾器（注意過濾器的氣流箭頭標志應與凈化單元出風氣流方向一致），確保邊框密封后將箱蓋回原位。